Учёные впервые реконструировали древние геномы человеческого бетагерпесвируса 6A и 6B (HHV-6A/B) из археологических останков человека возрастом более двух тысячелетий. Исследование, проведенное Венским университетом и Тартуским университетом (Эстония) и опубликованное в журнале Science Advance, подтверждает, что эти вирусы развивались вместе с людьми и внутри них, по крайней мере, с железного века. Результаты прослеживают долгую историю интеграции HHV-6 в хромосомы человека и позволяют предположить, что HHV-6A рано утратил эту способность.
HHV-6B инфицирует около 90 процентов детей в возрасте до двух лет и наиболее известен как причина детской розеолы – или «шестой болезни» – основной причины фебрильных судорог у маленьких детей. Вместе со своим близким родственником HHV-6A он принадлежит к группе широко распространенных герпесвирусов человека, которые обычно вызывают пожизненную латентную инфекцию после первоначального легкого заболевания в раннем детстве. Что делает их исключительными, так это их способность интегрироваться в хромосомы человека – особенность, которая позволяет вирусу оставаться в спящем состоянии и, в редких случаях, наследоваться как часть собственного генома хозяина. Такие унаследованные вирусные копии сегодня встречаются примерно у одного процента людей. Хотя более ранние исследования предполагали, что эти интеграции были древними, новые данные этого исследования предоставляют первое прямое геномное доказательство.
Восстановление вирусной ДНК из далекого прошлого
Международная исследовательская группа во главе с Венским университетом и Тартуским университетом (Эстония) в сотрудничестве с Кембриджским университетом и Университетским колледжем Лондона провела скрининг почти 4000 образцов человеческих скелетов из археологических раскопок по всей Европе. Были идентифицированы и реконструированы одиннадцать древних вирусных геномов — самый старый из них принадлежит молодой девушке из Италии железного века (1100–600 гг. до н.э.). Остальные особи охватывали широкий географический и временной диапазон: оба типа ВГЧ были обнаружены в средневековой Англии, Бельгии и Эстонии, а ВГЧ-6В также появлялся в образцах из Италии и ранней исторической России. Некоторые из англичан были носителями унаследованных форм HHV-6B, что делает их самыми ранними известными носителями хромосомно-интегрированных вирусов герпеса человека. В бельгийском регионе Синт-Трейден зарегистрировано наибольшее количество случаев, при этом оба вида вируса циркулируют в одной и той же популяции.
Хотя ВГЧ-6 в какой-то момент жизни заражает почти 90% человечества, только около 1% несут вирус, унаследованный от родителей, во всех клетках своего тела. Именно этот 1% случаев мы, скорее всего, идентифицируем с помощью древней ДНК, что затрудняет поиск вирусных последовательностей. Основываясь на наших данных, эволюцию вирусов теперь можно проследить на протяжении более чем 2500 лет по всей Европе, используя геномы с 8-го по 6-й век до нашей эры до наших дней».
Мериам Гуэллиль, ведущий исследователь исследования, Кафедра эволюционной антропологии Венского университета.
Древние интеграции, долгосрочные последствия
Восстановленные геномы позволили исследователям Чтобы определить, в каком месте хромосом вирусы интегрировались. Сравнение с современными данными показало, что некоторые интеграции произошли очень давно и передавались из поколения в поколение на протяжении тысячелетий. Один из двух видов вируса (HHV-6A), по-видимому, со временем утратил способность интегрироваться в ДНК человека – свидетельство того, что эти вирусы развивались по-другому, сосуществуя со своими человеческими хозяевами.
"Ношение копии HHV6B в вашем геноме связано с стенокардия – болезнь сердца», — говорит Шарлотта Хоулдкрофт (факультет генетики Кембриджского университета). «Мы знаем, что эти унаследованные формы HHV6A и B сегодня более распространены в Великобритании по сравнению с остальной частью Европы, и это первое свидетельство древних носителей из Британии».
Новая глава в эволюции вируса-хозяина
Открытие этих древних геномов HHV-6 дает первое Обнаруженные только в 1980-х годах вирусы HHV-6A и HHV-6B теперь можно проследить до железного века, предлагая прямые геномные доказательства древней общей истории между вирусами и вирусами. "Современные генетические данные позволяют предположить, что HHV-6 мог эволюционировать вместе с людьми со времени нашей миграции из Африки", - говорит Гуэллиль. "Эти древние геномы теперь предоставляют первое конкретное доказательство их присутствия в глубоком прошлом человечества".

04:00







