Люди, которые постоянно носят Staphylococcus aureus (S. aureus) в носу, имеют меньше видов других бактерий, в то время как некоторые бактерии могут помочь предотвратить S. aureus. aureus колонизация.
Таковы результаты крупнейшего в истории исследования микробиома носа, опубликованные сегодня (2 декабря) в Nature Communications.
В ходе исследования ученые из Института Уэллкома Сэнгера, Кембриджского университета, Бирмингемского университета и Имперского колледжа Лондона проанализировали мазки из носа более чем 1000 здоровых доноров крови, чтобы изучить сложные бактериальные сообщества, живущие в носу человека.
Исследование проливает новый свет на то, как взаимодействие между различными видами бактерий имеет ключевое значение для понимания того, почему некоторые люди постоянно колонизируются S. aureus а также предоставляет клиническую информацию для прогнозирования того, кто может подвергаться наибольшему риску заболевания S. aureus инфекция.
S. aureus – это распространенная бактерия, которая бессимптомно живет в носу примерно у 30 процентов людей. Обычно он не причиняет вреда, но если он попадает в организм через раны, порезы или хирургические разрезы, он может вызвать серьезные инфекции. Инфекции от S. aureus являются второй по распространенности причиной смертности от бактериальных инфекций после туберкулеза, вызывая примерно один миллион смертей в год. Некоторые штаммы, такие как метициллин-резистентный S. aureus (MRSA) устойчивы к обычным антибиотикам, что затрудняет лечение инфекций.
Исторически носители S. aureus были разделены на три группы: постоянные носители, интермиттирующие носители и неносители. У стойких носителей всегда положительный результат теста на носитель S. ауреус. У прерывистого носителя иногда бывает положительный результат теста, а у неносителей никогда не бывает положительного результата на носитель S. ауреус.
Поскольку С. aureus увеличивает риск послеоперационных инфекций, больницы часто проверяют пациентов перед такими процедурами, как замена суставов, и могут проводить назальные процедуры для уменьшения колонизации. Однако назальный микробиом, в отличие от кишечного микробиома, не изучался в больших популяциях, поэтому многое неизвестно о том, как S. aureus взаимодействует с другими назальными бактериями.
В новом исследовании исследователи из Института Сэнгера и их коллеги попытались проанализировать гораздо большую группу людей, чем в предыдущих исследованиях, чтобы досконально понять, как различные бактерии могут влиять на S. aureus колонизация.
В исследовании приняли участие добровольцы со всей Англии, которые ранее принимали участие в испытаниях донорства крови, проводимых Кембриджским университетом. Команда три раза в неделю собирала мазки из носа у 1100 здоровых взрослых. Каждый образец был протестирован на наличие S. aureus с использованием стандартных лабораторных методов культивирования и секвенирования ДНК было проведено для идентификации полного спектра видов бактерий, присутствующих в каждом мазке из носа. Исследователи использовали передовые статистические методы, чтобы выявить закономерности в назальном микробиоме и определить, является ли S. aureus может быть предсказано бактериальным сообществом.
Исследователи обнаружили две основные закономерности в микробиоме. Во-первых, команда обнаружила, что стойкие носители имеют особый микробиом с обилием S. aureus и отсутствие других видов в образцах из носа.
Во-вторых, некоторые бактерии, такие как Staphylococcus epidermidis, Dolosigranulum pigrum и Moraxella cataralis были менее распространены у персистирующих носителей. Исследователи предполагают, что эти другие виды могут помочь блокировать S. aureus у неносителей.
Используя машинное обучение, исследователи также смогли предсказать, кто постоянно колонизирован S. aureus особенно хорошо, предлагая возможный метод прогнозирования риска заражения.
Интересно, что исследователи также предполагают, что интермиттирующие носители — это просто неправильно классифицированные постоянные носители или неносители — понятие интермиттирующего носительства не отражает истинное биологическое состояние. Скорее всего, это не носители, которые подверглись воздействию S. aureus и заразились им в течение короткого периода времени.
Это исследование подчеркивает, что взаимодействие между различными видами бактерий является ключом к пониманию того, почему некоторые люди постоянно колонизируются S. aureus, что подвергает их большему риску заражения. Результаты имеют важное клиническое значение. Выявление носителей S. aureus может помочь предсказать риск заражения и позволить медицинским работникам лучше ориентироваться на тех, кому может быть полезно профилактическое лечение деколонизации.

15:00







