Шесть генов помогли точнее оценить прогноз при остром миелоидном лейкозе
Шесть генов помогли точнее оценить прогноз при остром миелоидном лейкозе
Исследователи из Центра геномной регуляции в Барселоне разработали систему оценки прогноза при остром миелоидном лейкозе (ОМЛ), основанную на активности шести генов. Результаты опубликованы в журнале Science Advances.
В показатель PHFScore вошли гены CARMIL1, HOPX, ALDH1A1, CALR, STAR и PHF19. У пациентов с неблагоприятным прогнозом активность первых трёх была выше, а последних трёх — ниже. Совместная оценка активности генов разделила пациентов на группы с существенно различающимися перспективами выживания.
«PHF19 сам по себе уже даёт некоторую информацию о прогнозе, но его сочетание с пятью другими генами заметно повышает точность оценки», — заявил старший автор исследования, профессор-исследователь ICREA и сотрудник центра Лучано Ди Кроче.
По мнению авторов, PHFScore может стать основой для будущих прогностических тестов. При подозрении на ОМЛ у пациента обычно берут образец костного мозга для лабораторного анализа; измерить активность шести генов проще и дешевле, чем изучать широкий генетический профиль. Некоторые из вошедших в показатель генов ранее не связывали с раком крови, и их роль ещё предстоит изучить.
Работа началась с изучения PHF19 — гена, участвующего в регуляции активности других генов по мере созревания клеток. В предыдущих экспериментах команда Ди Кроче обнаружила, что у мышей без PHF19 возникает состояние, напоминающее миелодиспластический синдром: клетки крови не созревают должным образом, но ещё не становятся раковыми.
В новом исследовании учёные ввели ген, вызывающий лейкоз, в клетки крови мышей с PHF19 и без него. Клетки без этого гена активнее образовывали колонии, легче приживались после пересадки и сохраняли незрелое, похожее на стволовое состояние. Они также хуже реагировали на химиотерапевтические препараты, которые применяют, чтобы стимулировать созревание лейкозных клеток.
Затем исследователи сопоставили результаты экспериментов с мышами и данные о пациентах. У молодых взрослых с ОМЛ низкая активность PHF19 была связана с меньшей продолжительностью жизни и более редкой ремиссией после стандартной химиотерапии: ремиссии достигали менее половины таких пациентов против 85% среди людей с наиболее высокой активностью гена.
«Потеря PHF19 сама по себе не вызывает лейкоз, но может стать шагом в этом направлении», — пояснил первый автор работы Джанни Гамарра. Исследование заняло пять лет; его проводили специалисты Центра геномной регуляции, в том числе при участии групп по анализу отдельных клеток и подразделений геномики и проточной цитометрии.
