Точное фенотипирование повышает точность генетического прогноза при нейросенсорной тугоухости

Исследовательскую группу клинических аудиологов, хирургов уха и других отоларингологов возглавил соавтор Энди ДеФриз, AuD, клинический аудиолог и кандидат наук из отделения слуха и речи Vanderbilt Health.

«Цель нашего исследования — понять генетическую архитектуру нейросенсорной тугоухости», — сказал ДеФриз. «В долгосрочной перспективе мы хотим уметь выявлять пациентов с риском потери слуха до её появления».

Как и при любой сенсорной функции, зависящей от субъективного восприятия пациента, точное описание конкретного случая потери слуха представляет трудность. Помимо физиологических измерений, аудиологам важно учитывать и тонкие особенности восприятия, которые не всегда отражают стандартные клинические записи.

Традиционно для описания состояния пациентов используются диагностические коды, однако их основная роль — учёт и выставление счетов, и они не всегда передают все нюансы каждого отдельного случая, отметил ДеФриз.

«Диагностические коды широко распространены, потому что такие данные доступны в крупных генетических биобанках и упрощают проведение исследований», — добавила она. «Но их использование создаёт своего рода «серую зону», в которой нельзя с высокой точностью определить, у кого действительно есть потеря слуха, а у кого — нет».

Исследователи деидентифицировали данные из своей клинической аудиометрической базы, чтобы интегрировать их с BioVU — биобанком анонимных генетических образцов Vanderbilt Health — и получить доступ к генетической информации согласившихся участников.

«Соединяя эти ресурсы, мы можем использовать более точный фенотип потери слуха вместо диагностических кодов, которые могут быть неточными», — сказал ДеФриз. «При размере выборки в 16 000 человек нам удалось лучше выявлять генетические варианты, связанные с потерей слуха».

Команда сопоставила аудиометрические фенотипы с генетическими данными в новой популяции и обнаружила, что оценки риска, построенные на основе точных фенотипов, точнее прогнозируют развитие потери слуха, чем оценки, основанные на диагностических кодах.

По словам ДеФриза, преимущества точного фенотипирования важны как в масштабах системы здравоохранения, так и на уровне отдельных пациентов.

«С точки зрения медицинских исследований мы убедились: создание биобанков, которые поддерживают точное фенотипирование, способствует новым открытиям», — сказала она. «Что касается потери слуха, точное фенотипирование улучшает прогнозирование риска. В будущем это позволит создавать инструменты, которые можно будет встроить в электронные медицинские карты или в потребительские генетические тесты, чтобы выявлять пациентов с более высоким или более низким риском развития тугоухости».

ДеФриз подчеркнула, что диагностические коды полезны для ряда задач, но представляют неполную картину в других областях, поэтому у таких учреждений, как Vanderbilt Health, есть хорошие возможности оценивать исследовательские методологии — например, точное фенотипирование — как дополнение к стандартным подходам.

«Различия в применении этих методологий в разных специальностях подчёркивают важность участия клиницистов в научных проектах», — отметил ДеФриз. «Vanderbilt располагает уникальным пересечением клинической практики и научных исследований, что делает возможным глубокое изучение этой темы».

Таха Ян, доктор медицинских наук, доцент кафедры отоларингологии — хирургии головы и шеи, отметил, что такая работа особенно важна в свете существующих возможностей для улучшения здоровья слуха.

«Мы воодушевлены этой совместной работой под руководством доктора ДеФриза», — сказал Ян, соавтор статьи. «Генетика становится всё более значимой для прецизионной терапии, особенно теперь, когда Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов одобрило свою первую генную терапию для генетической потери слуха. Эта работа демонстрирует, как клиницисты и учёные Vanderbilt Health расширяют границы точной медицины».

Исследование финансировалось междисциплинарным грантом Vanderbilt Lacy-Fisher, стипендиальным грантом Американского отологического общества и Национального института глухоты и других коммуникативных расстройств (часть Национальных институтов здравоохранения) — гранты R03DC021550, R21DC021276, R21DC023019, K08DC019683 и R21DC022058.